Добро пожаловать в класс превосходства 2 сезон

Киётака Аянокодзи и остальные ученики класса D продолжают обучение в престижной школе, где успех каждого класса определяется системой баллов и результатами специальных испытаний. После событий первого сезона ученики понимают, что обычных школьных знаний недостаточно для продвижения вверх, поскольку администрация регулярно создаёт ситуации, заставляющие подростков конкурировать друг с другом. Очередное испытание начинается на круизном судне, где учащихся распределяют по группам, составленным по определённым признакам. Участники получают специальные задания, однако правила построены таким образом, что прямое сотрудничество между всеми членами одной группы оказывается невозможным.

Каждая команда должна определить лидера, но настоящая задача заключается в обнаружении учеников, получивших скрытые роли. Киётака сохраняет осторожность и предпочитает не демонстрировать окружающим свои реальные способности. Хорикита Судзунэ пытается самостоятельно руководить действиями класса, стремясь улучшить положение группы и увеличить количество заработанных баллов. Кикё Кусида продолжает поддерживать образ дружелюбной ученицы, однако её отношения с Хорикитой остаются напряжёнными из-за событий прошлого. Кей Каруидзава постепенно оказывается ближе к центру событий, поскольку её положение среди учеников позволяет получать информацию о происходящем внутри других групп.

Параллельно Рюэн Кэру сталкивается с задачами, требующими выявить настоящего стратега класса D. Он подозревает, что Аянокодзи намеренно скрывает собственные способности и действует через других учеников. Рюэн начинает проверять различные версии, наблюдая за Хорикитой, Каруидзавой и другими участниками. После завершения испытания ученики возвращаются к обычным занятиям, однако противостояние между классами только усиливается. Следующим важным событием становится спортивное соревнование, где классы получают возможность заработать дополнительные баллы. Участники должны объединяться в группы, а результат отдельных учеников влияет на положение всего класса.