Кланнад: Продолжение истории

После окончания школьных событий Томоя Окадзаки и Нагиса Фурукава начинают строить совместную жизнь уже за пределами привычного школьного окружения. Их отношения постепенно переходят в семейные, а после окончания учебы Томоя устраивается на работу, чтобы самостоятельно обеспечивать себя и Нагису. Девушка продолжает бороться с проблемами здоровья, которые не исчезают после окончания школы и периодически вынуждают её оставаться дома. Несмотря на трудности, Нагиса старается поддерживать Томою, помогает ему в бытовых делах и продолжает участвовать в жизни окружающих людей. Спустя некоторое время пара решает пожениться, после чего начинается новый этап их совместной жизни.

Томоя получает работу электрика и проводит большую часть дня вне дома, тогда как Нагиса занимается собственными делами и постепенно начинает готовиться к будущему материнству. Вскоре становится известно, что девушка беременна. Сначала новость приносит радость обоим, однако врачи предупреждают о рисках, связанных с её слабым здоровьем. Нагиса продолжает беременность, несмотря на ухудшение состояния, а Томоя старается находиться рядом с ней и помогать во всём необходимом. Когда приближается срок рождения ребёнка, здоровье девушки становится ещё более нестабильным.

Томоя хочет оставить работу, чтобы постоянно находиться возле жены, но финансовые обстоятельства вынуждают его продолжать трудиться. Нагиса рожает дочь, которую родители называют Усио. Однако сразу после родов состояние молодой матери резко ухудшается, и она умирает. Томоя оказывается не готов к потере и погружается в тяжёлое состояние, из-за которого практически перестаёт участвовать в воспитании собственной дочери. Усио остаётся под присмотром Акио и Санаэ Фурукавы, которые стараются обеспечить ребёнку нормальную жизнь. Томоя продолжает работать, но практически не общается с дочерью и избегает дома, где всё напоминает ему о Нагисе.