Стрелок с чёрной скалы

Мато Курои начинает обучение в средней школе и практически сразу знакомится с Ёми Таканаси. Девушки быстро становятся близкими подругами, хотя их характеры сильно различаются. Мато отличается открытостью, энергичностью и стремлением помогать окружающим, тогда как Ёми ведёт себя гораздо спокойнее и осторожнее. Их дружба становится для обеих важной частью школьной жизни. Однако рядом с Ёми находится Кагари Идзуриха, девушка, которая с детства знает её и болезненно относится к любым новым знакомствам. Кагари воспринимает Мато как угрозу собственным отношениям с Ёми и постепенно начинает оказывать на подругу психологическое давление.

Ёми пытается сохранить отношения с обеими девушками, но постоянные конфликты заставляют её чувствовать себя виноватой. Вскоре Мато знакомится с Юу Котари, которая становится ещё одной важной фигурой в её жизни. Чем больше Мато общается с другими людьми, тем сильнее Ёми боится потерять единственную близкую подругу. Параллельно в другом измерении появляется девушка по имени Black Rock Shooter (BRS). Она выглядит как отражение Мато и сражается с другими существами, связанными с человеческими эмоциями. В этом мире существуют альтернативные версии людей, которые принимают физическую форму и выражают подавленные чувства своих человеческих двойников.

BRS сталкивается с Dead Master (DM), соответствующей Ёми, а их сражения постепенно начинают отражать события человеческого мира. После конфликта с Кагари состояние Ёми ухудшается. Девушка становится всё более зависимой от Мато и болезненно реагирует на её дружбу с Юу. В результате она оказывается изолирована от окружающих. В другом мире DM также подвергается влиянию Чариот — альтер-эго Кагари. Связь между двумя реальностями становится всё сильнее, поскольку эмоциональное состояние людей непосредственно влияет на происходящее среди их двойников. Мато пытается помочь Кагари избавиться от болезненной зависимости.