Врата Штейна: Зона загрузки дежавю

После событий, связанных с созданием машины времени и изменением мировых линий, Окабэ Ринтаро пытается продолжать обычную жизнь вместе с участниками лаборатории будущих гаджетов. Благодаря перемещениям между различными вариантами реальности он сохранил воспоминания о многочисленных событиях, которые остальные люди не помнят. Окабэ удалось изменить мировую линию и предотвратить гибель Макисэ Курису, однако последствия путешествий во времени оказались гораздо серьёзнее, чем предполагалось. В обычной жизни герой начинает испытывать странные приступы, во время которых теряет сознание и оказывается неспособен нормально воспринимать происходящее.

Сначала окружающие считают эти состояния последствиями пережитых событий, однако частота приступов постепенно увеличивается. Курису замечает изменения в поведении Окабэ и пытается разобраться, почему его состояние ухудшается. Она вспоминает сведения о существовании множества мировых линий и понимает, что сознание Окабэ подверглось огромной нагрузке из-за накопленных воспоминаний. Ситуация резко меняется, когда Окабэ внезапно исчезает из окружающей реальности. Для Курису это становится шоком, поскольку люди вокруг продолжают жить так, будто Окабэ никогда не существовал. Она оказывается единственной, кто замечает несоответствие и понимает, что исчезновение связано с воздействием мировых линий.

Курису начинает искать объяснение происходящему и обращается к сведениям, оставшимся после прежних экспериментов. Постепенно она узнаёт, что сознание Окабэ способно существовать одновременно в разных вариантах реальности, однако чрезмерная нагрузка может привести к его исчезновению из текущего мира. Для восстановления связи необходимо найти способ вернуть воспоминания и самого Окабэ в исходную мировую линию. Курису оказывается перед необходимостью использовать знания, полученные во время исследований машины времени, хотя любое вмешательство может вызвать новые изменения реальности. Она начинает сотрудничать с другими членами лаборатории, включая Хасиду Итару и Сиина Маюри, которые также замечают странности, связанные с отсутствием Окабэ.