Евангелион 1.11: Ты (не) один

После катастрофы, известной как Второй удар, человечество восстанавливает цивилизацию в условиях постоянной угрозы со стороны загадочных существ, называемых Ангелами. Главный герой Синдзи Икари получает вызов в Токио-3 от своего отца Гэндо Икари, возглавляющего специальную организацию NERV. Синдзи приезжает в город, не понимая причин неожиданного приглашения и рассчитывая хотя бы на возможность поговорить с отцом, с которым давно не поддерживал близких отношений. Однако сразу после прибытия он оказывается в центре боевых действий, поскольку на Токио-3 нападает Четвёртый Ангел.

Военные подразделения ООН пытаются остановить противника обычным вооружением, но их атаки не дают результата. Синдзи оказывается в опасной зоне, после чего его находит капитан Мисато Кацураги и доставляет в штаб NERV. Там Гэндо сообщает сыну, что единственным способом защитить город является пилотирование огромной биомашины Евангелиона-01. Синдзи не готов становиться участником боевых действий и не понимает, почему отец требует именно от него управлять машиной. Гэндо показывает ему раненую Рэй Аянами, которая должна была выйти на бой вместо него, несмотря на тяжёлое состояние. Синдзи меняет решение, садится в Евангелион-01 и впервые выходит против Ангела.

Управление огромной машиной оказывается чрезвычайно сложным, а получаемые Евангелионом повреждения отражаются на самом пилоте. Во время первого столкновения Синдзи теряет сознание после серьёзных повреждений, однако Евангелион-01 неожиданно активируется самостоятельно. Биомашина выходит из-под контроля и вступает в яростную схватку с Ангелом, после чего уничтожает противника. После завершения сражения Мисато становится опекуном Синдзи и забирает его к себе домой. Новый школьник постепенно начинает привыкать к жизни в Токио-3 и знакомится с одноклассниками, однако отношения с отцом остаются напряжёнными.