Евангелион нового поколения

Синдзи Икари приезжает в Токио-3 по вызову отца, которого не видел много лет. На улицах пусто, вокруг сирены и пустые машины. Вдруг из-за зданий появляется огромный Ангел. Синдзи пытается дозвониться до отца, пока рядом не останавливается Мисато Кацураги. Она забирает его и везёт в штаб NERV. Там Синдзи встречает Гэндо, но тот ведёт себя так, будто это не его сын и приехал он не к нему. Без объяснений отец ведёт его вниз, где за стеклом стоит Евангелион-01. Синдзи узнаёт, что именно на нём должен сражаться с Ангелом.

Он отказывается, потому что никогда не управлял такой машиной, но Гэндо показывает раненую Рэй Аянами, которую готовят к бою. Синдзи видит её на носилках и всё-таки садится в кабину. Евангелион поднимают на поверхность. Синдзи пытается двигаться, но получает удар и падает. Гэндо приказывает продолжать наступление, пока Синдзи явно не понимает, что ему делать. Евангелион снова поднимается, а потом бросается на Ангела уже без команд. В Синдзи прилетает ещё несколько ударов, но тот продолжает сражаться. В какой-то момент Ева-01 вцепляется во врага и начинает рвать его руками, после чего Ангел взрывается.

Синдзи приходит в себя в больнице и с непониманием, где он находится. Мисато принимает решение забрать его к себе домой. В квартире полный беспорядок, на кухне живёт пингвин Пен-Пен, а сама Мисато открывает банку пива и говорит Синдзи, что теперь он будет жить здесь. Ночью он лежит в своей новой комнате и вспоминает бой. Перед глазами снова и снова мелькает Ева-01, а затем Синдзи слышит голос Мисато за дверью. Она спрашивает, всё ли с ним нормально. Он отвечает, что всё нормально, и ложится спать.